چگونیان در گفت‌وگو با خبرنگار خبرگزاری دانشجو، در آخرین دیدار رهبر معظم انقلاب با دانشجویان و تشکل های انقلابی، یکی از فرامین ایشان به تشکل ها، هم افزایی بین تشکل ها بود. مطمئنا نکته مهمی است که تشکل های هم فکر، اختلافات جزیی را کنار بگذارند و در مواقعی در کنار هم صف آرایی کنند و چشم دشمنان را کور کنند که دشمن طاقت اتحاد ندارد.
امیرحسین چگونیان در گفت‌وگو با خبرنگار تسنیم در کاشان، درباره شکل‌گیری تشکل‌های سیاست‌زده دانشجویی اظهارداشت: برخی تشکل‌های دانشگاهی، نه اسلامی هستند و نه حتی دانشجویی و بهترین عبارتی که برای این تشکل‌ها می‌توان بکار برد، تشکل‌های یکبار مصرف انتخاباتی است. برخی تشکل‌ها محور فعالیت‌های خود را به صورت دیکته شده از بزرگان خود در بیرون از دانشگاه دریافت می‌کنند و در چاپ نشریه، برگزاری مراسم و حتی اعلام مواضع خود، استقلال ندارند و تابع هستند.
